之前寫過許多有關(guān)新冠核酸檢測試劑注冊相關(guān)文章,本文從科普角度,一方面為大眾介紹新冠核酸檢測試劑(熒光PCR法)注冊產(chǎn)品,另一方面為已取得新冠核酸檢測試劑(熒光PCR法)注冊證的生產(chǎn)企業(yè),說說生產(chǎn)注意事項。
之前寫過許多有關(guān)新冠核酸檢測試劑注冊相關(guān)文章,本文從科普角度,一方面為大眾介紹新冠核酸檢測試劑(熒光PCR法)注冊產(chǎn)品,另一方面為已取得新冠核酸檢測試劑(熒光PCR法)注冊證的生產(chǎn)企業(yè),說說生產(chǎn)注意事項。
新冠核酸檢測試劑(熒光PCR法)注冊及生產(chǎn)注意事項:
1、概述
新型冠狀病毒(2019 -nCoV)是一種具有急性呼吸道傳染性的RNA病毒,其直徑在100 nm左右,有四種主要的結(jié)
構(gòu)蛋白:刺突蛋白(Spike protein, S蛋白),核衣殼蛋白(Nucleocapsid, N蛋白),膜蛋白(Membrane protein, M蛋白),包膜蛋白(Envelope protein, E蛋白)。N蛋白在冠狀病毒中含量豐富,是一種高度免疫原性蛋白,參與基因組復制和細胞信號通路調(diào)節(jié)。目前已獲證的新型冠狀病毒(2019-nCoV)核酸檢測試劑主要針對的靶標包括ORF1ab基因,E基因和N基因,其反應原理以實時熒光PCR法為主流方法學。
新型冠狀病毒(2019-nCoV) 核酸檢測試劑(熒光PCR法)的基本原理是以新型冠狀病毒(2019-nCoV)的特異性基因(包括ORF1ab基因、E基因和N基因)設(shè)計特異性引物和TaqMan探針,通過熒光定量PCR儀進行擴增,從而實現(xiàn)對新型冠狀病毒(2019-nCoV) 核酸的檢測。臨床樣本核酸提取后,進行一步法RT-PCR擴增,并檢測熒光信號,儀器軟件系統(tǒng)自動繪制出實時擴增曲線。同時設(shè)置內(nèi)參照,主要對樣本采集、保存和運輸以及核酸提取過程進行監(jiān)控,避免假陰性結(jié)果的判。
2、產(chǎn)品組成(以某獲證產(chǎn)品為例)
通常由核酸擴增反應液、酶混合液、PCR檢測混合液、陽性對照和陰性對照組成( 見圖2)。擴增反應液中一般包含鎂離子、核苷酸混合液等擴增中必需的原料及緩沖液成分;酶混合液通常是各種酶的集合(如: DNA/RNA聚合酶、逆轉(zhuǎn)錄酶、UNG酶等) ; PCR 檢測混合液包括針對不同基因以及內(nèi)參基因的引物/探針,根據(jù)不同企業(yè)設(shè)計驗證的結(jié)果,組分的名稱及具體成分可能略有差異,比如可能存在dNTPs等原料與引物/探針配制于同一管檢測液中的情況;陽性對照是含有特異性片段的病毒樣顆粒,陰性對照通常是生理鹽水或樣本保存液。
3、預期用途
主要用于體外定性檢測新型冠狀病毒肺炎疑似病例、其他需要進行新型冠狀病毒感染診斷或鑒別診斷者的鼻咽拭
子、口咽拭子、痰液樣本等中,新型冠狀病毒(2019-nCoV)的0RF1ab、N基因和E基因。部分企業(yè)已獲證產(chǎn)品只針對其
中某一種或兩種基因。有關(guān)“疑似病例”等人群的定義參照《新型冠狀病毒肺炎診療方案》、《新型冠狀病毒肺炎防控方案》 等文件執(zhí)行。在使用上應當遵守《新型冠狀病毒肺炎診療方案》、《新型冠狀病毒肺炎防控方案》等文件的相關(guān)要求。開展新型冠狀病毒核酸檢測,應符合《新型冠狀病毒肺炎實驗室檢測技術(shù)指南》等的要求,做好生物安全工作。最終的檢測結(jié)果僅供臨床參考,不得作為臨床診斷的唯一標準。建議結(jié)合患者臨床表現(xiàn)和其他實驗室檢測對病情進行綜合分析。
4、規(guī)格型號
因體外診斷試劑產(chǎn)品的工藝特殊性,最終成品的規(guī)格區(qū)別通常在于分裝體積或檢測人份數(shù)的不同,如: 50人份/盒、
96人份/盒等。
5、產(chǎn)品性能(以某獲證產(chǎn)品為例)
5.1外觀
在自然光下以正常視力或矯正視力目視檢查,試劑盒各組分齊全,標簽字跡清晰,說明書內(nèi)容完整、詳細,外包裝盒完整。澄清均一液體,無肉眼可見渾濁或不溶性雜質(zhì)。
5.2陽性參考品符合率
按試劑盒說明書要求檢測國家陽性參考品,應符合相應規(guī)定?;驒z測企業(yè)制備的陽性參考品P1-P5,結(jié)果均為陽性。
5.3陰性參考品符合率
按試劑盒說明書要求檢測國家陰性參考品,應均為陰性?;驒z測企業(yè)制備的陰性參考品N1-N12,結(jié)果均為陰性。
5.4精密度
按試劑盒說明書要求檢測國家精密性參考品, 10次檢測結(jié)果均為陽性,且Ct值的變異系數(shù)(CV, %)應不高于5.0%?;驒z測企業(yè)參考品中的精密度參考品3份(J1、 J2和J3),重復檢測10次,計算精密度參考品J1.J2檢測結(jié)果FAM/VIC(HEX)通道的Ct平均值x和標準偏差SD,按式(1)計算變異系數(shù)CV,結(jié)果應不大于5. 0%; J3檢測10次結(jié)果均為陰性。
5.5最低檢出限
按試劑盒說明書要求檢測國家靈敏度參考品S,將其使用無RNA/DNA酶的去離子水進行1:3倍比稀釋(2份水+1份樣本,后同)后,將1:9、1:27、1:81. 1:243、1:729、1:2187.1: 6561、1:19683、 1:59049、 1:177147 分別標記為S1 ~S10,檢測結(jié)果S1^ S3應為陽性?;虬丛噭┖姓f明書要求檢測企業(yè)參考品中的最低檢出限參考品1份(L),重復檢測3次,結(jié)果均為陽性。
8、關(guān)鍵原材料及性能要求
該類產(chǎn)品的主要原材料包括引物、探針、酶、dNTP、核酸分離/純化組分(如有)、質(zhì)控品、參考品等。如主要原材料源于外購,供應商應固定,不得隨意更換。如主要原材料為企業(yè)自制,應能提供其詳細制備過程。
8.1引物和探針
質(zhì)量標準應至少包括序列準確性、純度、濃度及功能性實驗等。
8.2 dNTP
包括dATP、dGTP、 dCTP、 dTTP、 dUTP (如有),質(zhì)量標準應至少包括純度、濃度、功能性等。
8.3酶
需要的酶主要包括DNA聚合酶、逆轉(zhuǎn)錄酶、尿嘧啶DNA糖基化酶(如有)等,質(zhì)量標準應至少包括對酶活性和功能性等的驗證。
8.4質(zhì)控品
試劑盒一般包含陰性質(zhì)控品和陽性質(zhì)控品。陽性質(zhì)控品應包含試劑盒檢測的靶序列,可采用假病毒制備。質(zhì)量標準中應對質(zhì)控品的檢測結(jié)果Ct值范圍做出明確的要求。
8.5內(nèi)標
又稱內(nèi)對照,可對管內(nèi)抑制導致的假陰性結(jié)果進行質(zhì)量控制,應與靶核酸一同提取及擴增。質(zhì)量標準中應明確內(nèi)標的檢測結(jié)果Ct值范圍。
8.6企業(yè)參考品
一般包括陽性參考品、陰性參考品、檢出限參考品和重復性參考品。企業(yè)參考品應優(yōu)先采用臨床樣本,或者使用病毒培養(yǎng)物加入陰性基質(zhì)。無法獲得臨床樣本或病毒培養(yǎng)物企業(yè)需說明其合理性。質(zhì)量標準應包括功能性檢測等。應根據(jù)產(chǎn)品性能驗證的實際需要設(shè)置企業(yè)參考品。建議如下:
1)陽性參考品:著重考慮不同來源的病毒樣本和濃度要求,至少選取不同來源的5個病毒樣本。
2)陰性參考品:一般包括冠狀病毒(HKU1 .0C43、NL63、229E)、SARS冠狀病毒(可采用假病毒)、MERS冠狀病毒(可采用假病毒)、流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒等。不適用的陰性參考品企業(yè)需說明其合理性。
3)檢出限參考品:可采用95%陽性檢出水平或略高于檢出限的水平,如100%陽性檢出水平。
4)重復性參考品:一般包括高、低兩個濃度的樣本,其中一個濃度應為檢出限附近的濃度。
9、質(zhì)量控制點
9.1 PCR檢測混合液的配制;
9.2核酸擴增反應液的分裝(如有) ;
9.3酶混合液的分裝;
9.4 PCR檢測混合液的分裝;
9.5陰性對照的分裝;
9.6陽性對照的配制;
9.7陽性對照的分裝。
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